Museo de Arte Precolombino
Éste es el primer museo peruano que presenta a los visitantes los aspectos estéticos de los objetos exhibidos que pertenecen a antiguas culturas peruanas. Las piezas del museo son el trabajo sorprendente de hombres de la antigüedad, quienes desde tiempos inmemoriales trazaron una trayectoria que fuera seguida por los artistas peruanos y que los inspirara. El Museo intenta rescatar la obra de estos artistas anónimos, cuyas creaciones siguen siendo motivo de orgullo y admiración.
Museo Inca
Está ubicado en la calle Córdova del Tucumán 103, esquina con Ataúd. Exhibe una colección completa que presenta la evolución de la cultura andina del Valle del Cusco. El Museo está abierto de 8 a.m. a 5 p.m. de lunes a sábado y también los feriados, pero no los domingos.
Museo de Arte Religioso
Ubicado en la esquina de la Calle Hatunrumiyoc con la Calle Herejes. Exhibe una muestra de pinturas religiosas, muchas de las cuales pertenecen a la renombrada Escuela Cuzqueña. Está abierto de 9 a.m. a 12.30 a.m. y de 3 p.m. a 5.30 p.m., de lunes a sábado.
Museo Histórico Regional
Ubicado en la Casa Garcilaso, en la Cuesta del Almirante. Exhibe pinturas y antigüedades que retratan la historia del Cusco. Está abierto de 9 a.m. a 6 p.m. de lunes a sábado y de 9 a.m. a 12 a.m. los domingos.
Museo de Santa Catalina
Ubicado en la Plazoleta Santa Catalina. Exhibe arte religioso perteneciente a las colecciones del convento. Está abierto de 8 a.m. a 6 p.m. de lunes a sábado.
Museo de Arqueología
Ubicado en el Palacio del Almirante. Exhibe una colección de arte precolombino, pinturas españolas que retratan la realeza inca y que datan del siglo XVIII, así como una excelente colección de tejidos. Está abierto de 8 a.m. a 7 p.m. de lunes a viernes y de 8 a.m. a 2 p.m. los sábados.
Museo de Arte Contemporáneo
Ubicado en la Casa de Gobierno, en la Plaza del Regocijo. Está abierto de 9 a.m. a 1 p.m. y de 4 p.m. a 8 p.m. de lunes a sábado.
Museo de Historia Natural
Ubicado en la Plaza de Armas, en el Paraninfo Universitario. Está abierto de 9 a.m. a 12 a.m. y de 3 p.m. a 6 p.m. de lunes a sábado.